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編輯丨王多魚
排版丨水成文
理解冠狀病毒的刺突蛋白( Spike protein ) 的構(gòu)象變化,對于開發(fā)廣譜療法至關(guān)重要。刺突蛋白的氨基酸殘基 815-825 位點(以 S2′ 位點為中心) ,即 Spike815-825 是冠狀病毒的超廣譜抗原表位,其在融合前構(gòu)象中通常被隱藏, 但在與 ACE2 結(jié)合時(即病毒入侵細胞時)會短暫暴露。因此, 該表位可作為藥物及疫苗設(shè)計的靶點。
2026 年 5 月 6 日,復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院/上海市重大傳染病與生物安全研究院孫曉玉研究員、孫蕾研究員,廣州醫(yī)科大學(xué)王延群教授及復(fù)旦大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院謝幼華研究員作為共同通訊作者(包智恒、劉治民、張昭勇為論文共同第一作者),在國際頂尖學(xué)術(shù)期刊Nature上發(fā)表了題為:Steric hindrance of antibody binding in an Omicron spike fusion intermediate 的研究論文。
該研究揭示 SARS-CoV-2 入侵細胞瞬間超廣譜靶點Spike815-825 的動態(tài)變化,進一步闡明了奧密克戎變異株的全新逃逸機制,在此基礎(chǔ)上提出了“抗體小型化”策略,可顯著增強對多種奧密克戎亞變體及其他人冠狀病毒的抗病毒活性,為開發(fā)下一代高效、廣譜的抗冠狀病毒藥物指明了新方向。
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在這項最新研究中,研究團隊通過整合功能與結(jié)構(gòu)分析,發(fā)現(xiàn)靶向 Spike815-825 表位的抗體 76E1 能特異性識別一種早期融合中間構(gòu)象,其中該表位呈現(xiàn)為螺旋結(jié)構(gòu)(研究團隊將其稱為S2′-helix)。
研究團隊進一步發(fā)現(xiàn),SARS-CoV-2 奧密克戎變異株通過以下機制逃逸靶向該表位的抗體:早期融合中間構(gòu)象中 S2′-helix 位移導(dǎo)致的立體阻礙、S1 結(jié)構(gòu)域與 ACE2 距離受限,以及其更依賴組織蛋白酶介導(dǎo)的進入途徑(該途徑削弱了 76E1 對 S2′ 切割的抑制)。其中 H655Y 突變是逃逸的關(guān)鍵機制。
抗體的大小直接影響其接近 S2′-helix 的能力。重要的是,減小抗體尺寸能夠逆轉(zhuǎn)上述逃逸機制,并顯著增強對奧密克戎變異株及其他人類冠狀病毒(包括 SARS-CoV-1 和 HCoV-229E)的中和活性。
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S2'-helix 抗體中和與奧密克戎逃逸機制模式圖
總的來說,這些發(fā)現(xiàn)確立了靶向 S2′-helix 的抗體小型化策略作為開發(fā)泛冠狀病毒療法的可行路徑,為開發(fā)下一代高效、廣譜的抗冠狀病毒藥物指明了新方向。
總的來說,這項研究通過結(jié)構(gòu)功能分析,闡明了冠狀病毒刺突蛋白的動態(tài)構(gòu)象變化如何影響抗體中和效果,確立了靶向 S2′-helix 的抗體小型化策略是突破奧密克戎等變異株免疫逃逸,開發(fā)下一代高效、廣譜抗冠狀病毒藥物的關(guān)鍵路徑。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41586-026-10462-2
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