專訪聶再清教授：生物醫藥版“AI龍蝦”來了? 水木分子跑出“自研管線+工具賦能”雙輪模式

人工智能技術與生物醫藥產業的深度融合，正在重塑全球制藥行業的創新底層邏輯。

艾媒咨詢數據顯示，預計2026年全球AI制藥市場規模將達29.9億美元；中國市場的增速更為迅猛，2020年至2025年，五年市場規模增長超7倍。

市場的火熱并非空穴來風。2026年初的JPMorgan大會上，跨國藥企與英偉達等科技巨頭的重磅合作接連宣布；國內頭部藥企的BD交易與出海動作頻頻，AI技術正成為繼生物藥之后中國生物醫藥領域出海的另一張名片。

在這場行業變革中，由清華大學智能產業研究院（AIR）孵化的水木分子，憑借ChatDD智能體框架、OpenBioMed開源平臺、水木知了面向C端全新的生命科學“超級大腦”工具及多模態大模型等核心成果，走出“工具賦能+管線自研”的雙輪驅動路徑，成為AI制藥領域最具成長潛力的標桿企業之一。

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清華AIR孵化+前阿里AI大牛掌舵

清華大學萬國數據教授、AIR首席研究員聶再清教授擔任公司首席科學家

水木分子的誕生，離不開清華大學智能產業研究院（AIR）的科研沃土與核心團隊的跨界積淀。

水木分子成立于2023年6月，由張亞勤院士創辦的清華大學智能產業研究院（AIR）孵化，致力于打造生命科學領域的基礎大模型和智能體平臺。該公司的核心靈魂人物——發起人兼首席科學家聶再清教授，是清華大學萬國數據教授、AIR首席研究員，也是“十四五”國家重點研發計劃BTIT融合項目新藥研發大模型方向的課題負責人。

在加入清華之前，聶再清教授曾任微軟亞洲研究院首席研究員，是微軟學術搜索和微軟自然語言理解平臺LUIS的技術負責人；后加入阿里巴巴，擔任人工智能實驗室北京負責人和天貓精靈首席科學家，主導了天貓精靈這一戰略級智能助手項目的研發工作。

2020年，聶再清教授應邀加入清華大學智能產業研究院，將產業目光轉向了生物醫藥領域，“我們當時判斷，這一輪大模型帶來的技術革新影響巨大，影響力不小于我們經歷的任何一次工業革命。每一個行業都會被大模型和智能體技術改寫，而生物醫藥行業是最好的切入點。”

聶再清教授解釋，“這個行業有大量獨特的數據，尤其是蛋白質數據，它有自己的‘語言’和語法——氨基酸序列決定蛋白質的結構與功能，這種獨特性讓我們有機會打造區別于通用大模型的、真正解決行業痛點的的多模態大模型和產品，實現自然語言與蛋白質語言的跨模態翻譯，讓AI真正服務于生物科研創新。”

正是基于這一判斷，水木分子選擇以“蛋白質語言+自然語言”的多模態理解為核心，切入AI制藥賽道。目前，包括聶再清教授在內，水木分子聚合了一支全球頂尖的專家隊伍，組建了覆蓋科研、工程化、商業化的頂尖復合團隊——張亞勤院士、馬維英教授是水木分子的聯合發起人，前藥明康德副總裁邢杰出任首席運營官，前Pathos高級副總裁潘琦博士擔任生物醫藥首席科學家，形成了“AI技術+藥研經驗”的雙核心優勢。

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水木分子正在成為AI大模型賦能的藥物研發創新企業

隨著潘琦博士——這位擁有二十余年貫穿靶點發現、藥物研發、臨床轉化及戰略合作的端到端經驗, 國際生物醫藥領域資深的研發與管理專家，強勢加盟水木分子，出任生物醫藥首席科學家（Chief Scientific Officer, Biopharmaceuticals）。她全面負責公司生物醫藥與ChatDD（AI智能體驅動的人機協作藥物研發） 科研戰略、研發體系建設、AI 藥物管線推進及全球合作布局，并組建團隊, 實現干濕實驗閉環,為水木分子的長期競爭力與持續發展注入核心動能。

水木分子選擇從自免領域的適應癥入手建立了第一條自研管線。這次選擇的是一類由復雜多信號通路網絡調控的自身免疫性疾病，現有療法僅僅針對單一靶點，療效有限。基于 ChatDD-Insight 對致病機制的系統分析， 決定用人工智能設計雙特異性抗體，同時阻斷兩條核心信號通路。目前，基于ChatDD-Discovery平臺的計算設計已經完成，已產出多款性能優異的候選分子, 接下來會繼續進行濕實驗和臨床前的驗證。

在推進管線項目的同時，水木分子正在同步構建兩大核心能力：一是AI驅動的雙特異性抗體設計平臺；二是面向自免疫疾病的雙靶點組合洞察與驗證體系。

未來，水木分子將把這一能力擴展到腫瘤及更多疾病領域，用人工智能高速、系統性地打造一系列創新藥物管線。

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雙端產品爆發：OpenBioMed開源破局，大模型產品水木知了普惠行業

在核心團隊帶領下，水木分子成立以來實現了快速發展，里程碑成果不斷涌現。水木分子已推出全球首個生物醫藥研發智能體ChatDD、首個多模態開源版大模型BioMedGPT和商業版大模型ChatDDFM?。據水木分子披露，目前公司已與30+知名品牌達成合作，2025全年訂單金額同比增速超過100%，儲備客戶數量超100家。

這一發展勢頭在2026仍被延續，近期，水木分子的產品矩陣再迎關鍵升級：B端開源平臺OpenBioMed Skills正式發布，C端切入的行業大模型產品水木知了?開啟公測。這一“雙賦能”策略，標志著水木分子形成了“B端賦能專業研發、C端普惠行業人群”的雙產品矩陣，公司正從技術驗證邁向生態構建的新階段。

■ 堪比生物醫藥領域的「AI 龍蝦」爆款應用OpenBioMed Skills

“如果要做生物醫藥版的‘小龍蝦’，最缺的是生物醫藥的專業技能。”OpenBioMed Skills正是這一思路的產物，其底層邏輯源于聶再清教授團隊對藥研痛點的深刻洞察：“傳統藥研中，很多環節只能依賴老法師（專家）經驗，而通用Skill庫大多只是簡單封裝工具使用文檔，無法真正解決復雜的科研問題。”

OpenBioMed Skills的核心突破在于將分散在學術期刊、工具文檔、專家頭腦中的知識，系統性沉淀為可共享、可迭代的技能庫，讓科研人員無需深厚編程功底，通過自然語言對話即可搭建并運行端到端的藥研工作流。首批發布的45項精選技能分為5大類，覆蓋生物化學/藥物研發、蛋白質分析與設計、單細胞組學分析，同時也提供數據檢索、工具調用等輔助技能。

Skills架構圖，圖源水木分子

與市面通用Skill庫相比，OpenBioMed Skills擁有顯著差異化優勢。它聚焦長線工作流設計，實現多工具協作、端到端執行與實時反饋調整。同時，它引入人機協作模式，將專家知識和決策集成到AI技能中，創建“專家大腦的數字分身”，內置領域解讀框架對專業數據進行行業語境下的解讀，“就像生物醫藥版OpenClaw”。此外，該產品支持完全本地化部署，所有數據處理和模型推理均可在用戶私有環境中完成，致力于從根本上杜絕數據泄露。

聶再清教授表示，“OpenBioMed Skills的推出，標志著生物醫藥AI從‘工具可用’向‘專家能力可復用’的范式轉變。”

目前，OpenBioMed Skills已部署至OpenBioMed平臺，可直接調用PharMolixFM、BioMedGPT-R1、MutaPLM等自研多模態模型，代碼已在GitHub開源，專家通過飛書、釘釘、微信即可遠程指揮生物醫藥Agent。

■ “AI生命科學情報助手”水木知了

在B端產品開源的同時，水木分子推出的C端產品“水木知了”正式開啟公測，該產品源自內部的ChatDD-Insight模型，聚焦生命科學領域的情報解讀與知識普惠，填補了C端專業生命科學AI工具的市場空白。

生命科研領域每天都有大量的情報信息產生，比方說新的技術平臺、AI模型、靶點、臨床前藥物研發進展、臨床實驗進展、醫療器械、生物制造、管線交易、融資信息等各方面信息。水木知了會24小時不停歇地工作，為每個用戶個性化地過濾重復、泛泛而談的無效噪音，只將真正高價值的內容推送到你面前。你無需再在大海撈針，信息篩選效率直接提升 10 倍。

同時，水木知了基于ChatDDFM?系列模型，可以針對用戶的不同認知水平提供分層服務：對行業“小白”以通俗語言解釋專業概念；對有一定經驗的研究者提供深度但易懂的解讀；對專家級用戶則開放權威知識圖譜，支持深度交流與AI咨詢。

“水木知了更像是一個‘情報助手’，”聶再清教授介紹，“它可以解讀今天發表的論文、行業動態，也可以回答用戶的具體問題。把藥物研發領域的高深黑話、行業術語、復雜機制用通俗易懂的方式給用戶解讀。我們設置了深度思考模式、自動決策模式和‘小紅書’風格模式，希望既能幫助科研人員提升信息獲取效率，也能助力生物醫藥知識普惠普及——實現原本只屬于煉丹老法師們的知識‘平權化’。”

此外，該產品目前完全免費，當然不排除未來推出的深度報告、專業咨詢等占用大量GPU資源的場景下考慮收費，B端客戶也可選擇內部部署專業版水木知了，進一步擴大了產品的覆蓋范圍。

基于上述產品，在合作生態方面，水木分子與數十家頭部生物醫藥企業、醫院和科研機構建立了深度合作，形成了“技術輸出+合作研發”的多元化商業模式。

在出海布局方面，水木分子已啟動相關規劃，分為工具出海與管線出海兩大路徑，目前在工具出海領域達成相關合作，在東亞市場已取得初步進展，未來將逐步拓展全球市場。

當AI技術真正成為科研工作者的通用工具，生物醫藥科研的奇點時刻或將加速到來。水木分子的探索，正是這一變革的縮影——不是取代專家，而是讓專家的經驗與直覺通過智能體得以規模化復用；不是閉門造車，而是通過開源生態讓最前沿的AI能力成為行業基礎設施。從清華實驗室到產業一線，從代碼開源到管線自建，水木分子的故事正在繼續。

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