據不完全統計,截至 2025 年,空間轉錄組分析工具已達 594 款,橫跨 77 種技術平臺[1]。這不僅折射出該領域的蓬勃活力,更映射出一個讓無數科研工作者感同身受的尷尬現實:在同一次實驗中,要在視野、分辨率與基因覆蓋之間做出「取舍」,已成為這個領域的某種「宿命」。
空間組學的核心困境,被業內形象地稱為「不可能三角」——大視野 vs 高分辨率 vs 全轉錄組,三者似乎永遠無法兼得。同樣令人困擾的,是靈敏度與通量之間的矛盾——不斷提升檢測通量的同時,往往要犧牲對稀少轉錄本的捕捉能力。
過去,許多研究者不得不在這些核心維度間反復權衡,被迫在深度(檢測范圍)與廣度(樣品規模)中取舍。想象一下——你站在切片機前,手里只剩最后一張發黃的組織切片,甚至沒米粒大。它的「前世」并不樂觀:在福爾馬林里泡了半年,RNA 質量被判「死刑」。問了三家測序公司,回復如出一轍:「降解嚴重,建議重新取材。」這意味著再等半年,而課題等不起了。你盯著那張切片,不敢動手,一旦上機失敗,這個課題就真結束了。
這是過去空間組學研究的真實困境:不是因為科學問題不夠好,而是技術不允許你犯錯。珍貴的樣本成了不敢嘗試的樣本。
近日,10x Genomics 以一場名為「Impossible」的發布會,正式發布空間原位分析新平臺Atera。它正面解構了「不可能三角」,在大視野(> 5 cm2)、亞細胞分辨率與高通量轉錄組檢測(覆蓋 > 18,000 個基因)之間實現了性能層面的全面提升,為空間生物學研究提供新的技術路徑。
北京時間2026 年 5 月 8 日上午 10:00,10x Genomics 將舉辦Atera 平臺中文網絡研討會。資深科學家將詳解全轉錄組空間解析的實際應用、高通量隊列研究案例及關鍵性能數據,并現場答疑。
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Atera 如何重塑科研邊界?
1. 全轉錄組覆蓋 + 多維定制:終結「盲人摸象」式研究
Atera 全面覆蓋 18,000+ 蛋白質編碼基因,并支持在全轉錄組基礎上疊加最多 1,000 個自定義基因。同時提供 Atera Select 模塊化靶向 panel(1,000~2,000 重)和完全定制 panel(最多 1,000 基因),可檢測 SNVs、基因異構體、病毒序列及 CRISPR 向導 RNA。一次實驗,兼顧探索與驗證,終結「盲人摸象」式研究。
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Atera WTA 全轉錄組、panel Atera Select 模塊化、panel Atera 完全定制 panel
2. 產能全面釋放:年 800+ 全轉錄組樣本處理能力
系統單次運行支持 4 張標準載玻片,單張成像面積超 500 mm2,年處理能力高達 800 個 1 cm2 全轉錄組樣本。與傳統平臺 Xenium 相比,通量提升約 4 倍,手動操作僅需 3~4 小時,樣品準備周期 2~3 天。單臺 Atera ≈ 4 臺 Xenium,極大優化人力與設備投入成本。
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3. 單細胞級靈敏度:精準捕捉被「淹沒」的生物學信號
根據 10x Genomics 官方內部測試(宮頸癌、乳腺癌 FFPE 樣本),Atera 假陽性率低于 5%~11%;單個海馬神經元可檢測超 23,000 條轉錄本。Atera WTA 與 Chromium Single Cell Flex 的基因表達相關性 r2 = 0.75,定量結果與傳統單細胞測序高度一致,讓低豐度轉錄本和稀有細胞無處遁形。
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4. 更智能的數據基礎設施:解放計算力,聚焦科學
Atera 配套云端分析平臺,無需編程與命令行操作,即可在瀏覽器中完成空間數據的可視化與挖掘。支持 10x Genomics Cloud 或第三方云服務,數據瞬間傳輸、跨團隊協作無障礙。研究人員可將精力從繁瑣的計算中解放出來,真正聚焦科學問題本身。
5. 生態初成:10x Genomics 整體戰略協同推進,Atera 未來已來
隨著 Atera 發布,10x Genomics 同步推出 Catalyst Research Services 專業樣本檢測服務,提供從原始圖像到生物學結論的全鏈條加速。遠期路線圖包括空間蛋白質組學、堿基測序、多物種 WTA panel 及 3,000-plex Select 模塊。一個完整的空間多組學生態正在形成。
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17 世紀,顯微鏡讓人類首次看見細胞;20 世紀,測序技術讀通基因藍圖;2026 年,Atera 讓科研人員同時看到細胞在哪兒、表達什么、微環境長什么樣——終于無需再做「交集性妥協」。我們堅信,Atera 將為生物標志物發現、藥物開發與精準醫療開啟全新可能。
北京時間2026 年 5 月 8 日上午 10:00
Atera 平臺中文網絡研討會
期待您的參與!
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內容策劃:王丹琦
內容審核:朱卿
題圖來源:圖蟲創意
參考文獻
[1] GUO Z Z, WU R, LI W, et al. Mapping biology in space: from spatial transcriptomics platforms to analytical tools and databases [J]. Sci Bull (Beijing), 2026, 71(4): 921-45.
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