浙江
當你拿到寶貴的組織切片，準備開展一次空間原位實驗時，腦海中是否盤旋著這些實際問題：樣本該切多厚？新鮮冷凍和石蠟包埋的流程有何不同？幾百個基因的 panel 該如何設計？數據量巨大，又從哪里看起？
對于任何計劃將單細胞數據升級到空間維度的研究者來說，這些實操細節，遠比「樣本是否稀有」更令人卻步。 無論你的樣本是穿刺得來的一小塊，還是常規手術標本，一份清晰的「實戰手冊」，往往比理論講解更能讓你安心地邁出第一步。
Xenium 空間原位技術可以絲滑破局這些問題：一張切片可同時解析數千個基因、蛋白和形態學，幫你從實驗規劃到腫瘤微環境免疫亞群、阿爾茨海默病病理分析一步到位。想讓您的單細胞數據無縫躍升至空間原位層面？我們為您整理了【Xenium 空間原位技術實戰手冊】（包含實驗規劃指南、樣本制備避坑及前沿研究案例等），掃碼下方二維碼，即可免費領取。
精彩內容搶先看
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實驗規劃第一步：八個核心問題助您理清思路
在正式開展空間原位分析前，先問自己這 8 個問題，能幫你少走幾個月彎路：我想回答什么科學問題？需要哪些設備或經驗？樣本該如何保存、切片、放置？如何選擇靶點？細胞分割怎么實現？數據怎么分析和可視化？存儲空間夠不夠？——在資料包中針對這些問題都逐一給出了答案。
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樣本制備避坑指南：新鮮冷凍與 FFPE 的切片厚度、溫度及放置技巧
新鮮冷凍樣本：推薦切片厚度 10 μm，刀片溫度 -20℃、樣本頭溫度 -10℃。長時間切片時，建議短暫關閉冷凍室以使溫度平衡。
FFPE 樣本：推薦切片厚度 5 μm，水浴溫度 42℃。首次運行前建議使用非實驗組織塊進行 HE 染色練習，并優化切片參數。
組織放置：Xenium 載玻片樣本區約 236 mm2，切片之間不重疊即可。制備好的載玻片可儲存長達兩個月，無需當日立即上機。
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四種靶點選擇路徑，適配不同研究需求
預設計基因組合：針對特定生物靶點，采用數據驅動策略設計，可直接使用。
附加定制：在預設計組合基礎上添加最多 100 個自定義基因。
完全定制：針對大多數具有完備轉錄組注釋的物種，設計多達 480 個基因。
蛋白質亞組合：可同時檢測 23 種蛋白質及 4 種細胞分割標志物，實現 RNA 與蛋白同片共檢。
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細胞分割的多模態算法：三步定邊界
Xenium 機載軟件自動完成細胞分割：第一步直接推斷細胞邊界，可區分 0 個、1 個或多個細胞核；第二步對有單個細胞核的細胞進行內部分割；第三步對缺失邊界或內部染色的細胞進行細胞核擴展，擴展距離為 5 μm（或直至遇到另一個細胞的邊界）。每個細胞的轉錄本分配清晰可追溯。
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數據分析和可視化工具
運行結束時即可獲得可解讀的數據，無需額外等待。免費桌面軟件Xenium Explorer支持任意縮放、平移及單條轉錄本的可視化。數據以開放格式輸出，亦支持第三方工具進行深度擴展分析。
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實戰案例速覽（資源包內附完整報告）
腫瘤微環境：利用 380 基因的 Xenium 人類免疫腫瘤學組合，在卵巢癌、肺癌、胰腺癌和腦癌樣本中精準區分癌細胞、免疫細胞與基質細胞，識別 T 細胞耗竭、三級淋巴結構及膠質母細胞瘤假柵欄結構。
阿爾茨海默病模型：采用定制 347 基因的小鼠大腦組合，定位 Aβ 斑塊周圍 50 μm 內活化膠質細胞的富集及多種斑塊誘導基因（PIG）的上調，空間分辨率達到亞細胞水平。
內容策劃：王丹琦
內容審核：朱卿
題圖來源：圖蟲創意
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