Cell Discovery |?揭秘基因組“暗物質”：萬人規模我國人群轉座子全景圖譜發布

轉座子 （ Transposable elements, TEs ） 占據人類基因組約 50% 的序列，是基因組進化及致病 遺傳 變異的重要驅動力。盡管近年來大規模全基因組測序（ WGS ）極大地推進了人類遺傳學研究，但受限于檢測技術與樣本代表性， 我 國人群大規模、高深度的轉座子插入 圖譜 仍 不夠完善 ，這限制了我們對人群基因組異質性及復雜疾病機制的深 入 理解。

近日，山東大學齊魯醫院陳玉國教授 、上海交通大學 醫學院附屬 瑞金醫院寧光院士和曹亞南研究員 、以 及南京醫科大學沈洪兵院士 團隊合作在Cell Discovery發表了題為：The landscape of human transposable element insertions in Chinese population的 論文。該研究系統性地描繪了我國人群轉座子插入的全景觀，開發了新型計算模塊并揭示了轉座子與復雜疾病之間的潛在關聯。

研究依托 ChinaMAP 隊列，對 10,013 例全基因組測序數據進行了深度挖掘，鑒定出 69,092 個轉座子插入事件，包括 51,045 個 Alu 、 12,929 個 LINE-1 和 5,118 個 SVA 。進一步發現，轉座子呈現出不同的 群體 分布特征：如藏族人群 表 現最高的插入負荷，而彝族和苗族人群則相對較低。這一結果提示，轉座子活動在不同人群的遺傳背景形成與進化選擇中發揮了差異化作用。在與全球結構變異數據庫 gnomAD-SV 的橫向比較中，僅有約 13% 的插入事件為共享，展現出我國人群轉座子圖譜的高度獨特性。通過對比 1000 Genomes Project 的非東亞樣本，研究系統界定了我國人群特異性的轉座子譜系，結果顯示高達 88% 至 92% 為我國人群特有。這一結果表明，構建我國人群轉座子圖譜在精準醫學研究及復雜疾病遺傳解析 中 具有不可替代性。 進一步， 通過將轉座子插入與鄰近單核苷酸多態性（ SNP ）進行連鎖分析，成功識別出 22 個與疾病顯著相關的候選插入位點 ，從而 為揭示非編碼區結構變異如何通過調控順式作用元件驅動復雜疾病提供技術支撐。 此外， 通過對 98 例非小細胞肺癌樣本的分析，研究鑒定出 4,731 個體細胞 LINE-1 插入事件，并在近半數樣本中觀察到了活躍的逆轉錄現象 。

總體 而言 ，研究利用大規模人群數據，系統性地描繪了我國人群轉座子插入的攜帶頻率與群體分布特征，指出了轉座子在塑造人群遺傳多樣性與驅動進化過程中的作用 ，揭示了轉座子與復雜疾病風險位點的連鎖關聯 ，為深入理解 人群基因組異質性及復雜疾病 遺傳 機制 提供新見解 。

山東大學齊魯醫院王甲莉教授 、 瑞金醫院長三角健康研究院 萬勝青 、 以及南京醫科大學 向 俊教授是本文的共同第一作者。

原文鏈接：https://doi.org/10.1038/s41421-026-00886-5

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