世界第一只狗？利用全基因檢測(cè)，科學(xué)家發(fā)現(xiàn)最早家犬遺骸！

人類與狗之間的感情，堪稱自然界最為持久穩(wěn)固的伙伴關(guān)系之一，但這種關(guān)系究竟何時(shí)開始一直是個(gè)謎。

早期馴化的家犬和灰狼長(zhǎng)得幾乎一模一樣，光看骨骼大小和外形，根本難以精準(zhǔn)區(qū)分，之前的研究要么僅能獲取破碎的線粒體DNA片段，要么只能依靠骨骼形態(tài)進(jìn)行推測(cè)，如此一來，研究所得出的結(jié)論往往引發(fā)巨大爭(zhēng)議，始終無法得出確鑿無疑的定論。

直至近期（2026年3月25日），發(fā)表于《自然》雜志的一項(xiàng)研究，研究人員借助最為前沿且可靠的古基因組技術(shù)，成功揭開了歐洲前農(nóng)業(yè)時(shí)代早期家犬基因組的演化進(jìn)程。

不僅如此，該研究還刷新了憑借全基因組數(shù)據(jù)，得以證實(shí)歐洲地區(qū)家犬的最早紀(jì)錄。

此樣本亦是當(dāng)前全球范圍內(nèi)有全基因組數(shù)據(jù)支撐的最早家犬樣本之一。

這次研究團(tuán)隊(duì)一口氣分析了216具遠(yuǎn)古犬科遺骸，其中181具都來自歐洲舊石器時(shí)代和中石器時(shí)代，也就是農(nóng)業(yè)還沒出現(xiàn)、人類還靠狩獵采集為生的年代。

但遠(yuǎn)古骨頭里的DNA降解太厲害，95%的舊石器和中石器時(shí)代樣本里，屬于犬科本身的內(nèi)源DNA不到5%，79%的樣本甚至連1%都不到，剩下的幾乎全是微生物污染。

為攻克這一難題，研究團(tuán)隊(duì)運(yùn)用了專業(yè)的全基因組靶向捕獲技術(shù)，將目標(biāo)DNA的含量直接富集至原來的10到100倍。

最終，成功為141具遺骸完成了精準(zhǔn)的狼或狗的遺傳身份鑒定。

不僅如此，還對(duì)其中7個(gè)樣本開展了深度全基因組測(cè)序。

最后，將所獲取的遺傳數(shù)據(jù)與上千組現(xiàn)代及古代犬科的基因組進(jìn)行了全面比對(duì)。

此項(xiàng)研究最為重大的成果，源自瑞士凱斯勒洛克遺址中一具距今14200多年前的犬科遺骸。

基因檢測(cè)確鑿證實(shí)，這是目前有全基因組數(shù)據(jù)支撐的最早家犬，屬于冰河時(shí)期的馬格德林狩獵采集文化。

更關(guān)鍵的是，它和后來全球各地的家犬共享同一套祖先譜系，直接推翻了歐洲舊石器時(shí)代的狗完全來自本地灰狼獨(dú)立馴化的假說，也就是說，那些陪伴歐洲原始人類的早期家犬，并非由歐洲本地灰狼馴化而來，研究并未檢測(cè)到同期歐洲晚冰期灰狼對(duì)它們存在可檢測(cè)的遺傳貢獻(xiàn)。

同期于《自然》雜志發(fā)表的配套研究，同時(shí)揭示了亞洲地區(qū)家犬古基因組的關(guān)鍵發(fā)現(xiàn)，為歐亞大陸家犬起源與擴(kuò)散這一拼圖補(bǔ)上了至關(guān)重要的一塊。

目前，經(jīng)全基因組測(cè)序證實(shí)的亞洲地區(qū)最早家犬，是來自安納托利亞半島（今土耳其境內(nèi)）皮納爾巴什遺址、距今15800年前的犬科遺骸。

這也是目前全球范圍內(nèi)有全基因組數(shù)據(jù)支撐的最為古老的家犬，其年代相較于歐洲凱斯勒洛克遺址的樣本，早了1600年。

這一發(fā)現(xiàn)確鑿地證實(shí)，早在1.5萬年前，家犬便已在歐亞大陸東西兩端同步完成了穩(wěn)定的種群分化，并與不同地區(qū)的狩獵采集人群構(gòu)建起了穩(wěn)固的共生關(guān)系。

至于東亞地區(qū)，目前有全基因組數(shù)據(jù)支撐的最早家犬樣本，一是來自東南西伯利亞哈蒂斯特爾洞穴、距今9682年前的個(gè)體，二是俄羅斯若霍夫島、距今9515年前的家犬遺骸。

相關(guān)基因組研究成果于2025年發(fā)表在《科學(xué)》期刊上。

中科院昆明動(dòng)物研究所團(tuán)隊(duì)完成的中國(guó)首個(gè)古代家犬全基因組測(cè)序工作，獲取了14個(gè)來自中國(guó)河西走廊、新疆、內(nèi)蒙古地區(qū)，年代跨度從9700年至870年前的家犬全基因組數(shù)據(jù)。

這是目前東亞大陸最為系統(tǒng)的古代家犬基因組數(shù)據(jù)集。

而在更早期的遺存研究中，中科院古脊椎動(dòng)物與古人類研究所團(tuán)隊(duì)在2024年《分子生物學(xué)與進(jìn)化》發(fā)表的研究里，獲取了中國(guó)黑龍江哈爾濱遺址、距今12900年前家犬的高質(zhì)量線粒體全基因組。

這是目前東亞地區(qū)有遺傳學(xué)數(shù)據(jù)支撐的最早家犬遺存，屬于舊石器時(shí)代末期的狩獵采集文化，其年代僅晚于歐洲和安納托利亞的全基因組家犬樣本，有力地證實(shí)了東亞地區(qū)在冰河時(shí)代末期已出現(xiàn)穩(wěn)定的家犬種群。

從時(shí)間線對(duì)比來看，目前全球有全基因組確切證據(jù)的最早家犬紀(jì)錄，是來自亞洲安納托利亞半島、15800年前的樣本，早于歐洲14200年前的家犬紀(jì)錄；東亞地區(qū)有遺傳學(xué)數(shù)據(jù)支撐的家犬遺存，最早可追溯至12900年前，同樣處于冰河時(shí)代末期的前農(nóng)業(yè)社會(huì)，僅略微晚于歐洲最早的全基因組家犬樣本。

基因比對(duì)還有個(gè)顛覆認(rèn)知的發(fā)現(xiàn)：這些1萬多年前的歐洲家犬，與同期生活在歐洲的本地灰狼幾乎沒有親緣關(guān)系，反而與歐亞大陸東部的晚冰期灰狼有更強(qiáng)的遺傳親緣性。

而且早在14200年前，歐洲家犬的種群遺傳分化就已經(jīng)清晰出現(xiàn)，這也說明，狗的馴化時(shí)間必然比這個(gè)時(shí)間點(diǎn)還要早幾千年，不然根本來不及形成穩(wěn)定的種群遺傳差異。

而東亞家犬的線粒體基因組與核基因組數(shù)據(jù)，均顯示出極高的遺傳多樣性，進(jìn)一步印證了家犬的祖先譜系核心起源于歐亞大陸東部，隨后伴隨人類遷徙向西擴(kuò)散至歐洲的演化路徑，這也正是歐洲早期家犬與東亞灰狼親緣性更強(qiáng)的核心原因。

這次研究還解開了農(nóng)業(yè)革命對(duì)狗種群的影響。

1萬年前西亞的農(nóng)耕人群進(jìn)入歐洲，當(dāng)?shù)蒯鳙C采集人群的血統(tǒng)被替換了70%到80%，但狗的命運(yùn)完全不同。

數(shù)據(jù)顯示，西亞農(nóng)耕人群帶來的家犬血統(tǒng)，對(duì)歐洲本地狗的血統(tǒng)替換比例最高也只有66%，多數(shù)地區(qū)僅在20%左右。

也就是說，歐洲本土狩獵采集部落所飼養(yǎng)的狗，并未隨著人類族群的更迭而消逝，相反，它們大量融入了農(nóng)耕時(shí)代的犬群之中。甚至在如今的歐洲犬種里，約有一半的血統(tǒng)源自這些早在冰河時(shí)期便陪伴人類左右的忠實(shí)伙伴。

而在東亞大陸，家犬的血統(tǒng)延續(xù)性更為穩(wěn)定：全新世以來，東亞家犬的核心血統(tǒng)始終占據(jù)主導(dǎo)，僅在青銅時(shí)代出現(xiàn)少量歐亞草原西部家犬的血統(tǒng)滲入，并未發(fā)生大規(guī)模的種群替換，中國(guó)北方黃河流域距今7000年至2000年的家犬線粒體譜系，至今仍能在東亞本土家犬種群中找到遺傳痕跡。

有意思的是，此次研究有力地糾正了以往的認(rèn)知偏差。

例如，比利時(shí)戈耶特洞穴中一具距今13700年前的遺骸，此前因體型較小、存在人工改造痕跡以及紅色染色痕跡，被學(xué)界廣泛認(rèn)定為早期家犬，然而，此次基因檢測(cè)確鑿證實(shí)，其遺傳成分完全屬于狼。

同樣的認(rèn)知修正也發(fā)生在亞洲考古領(lǐng)域：此前西伯利亞阿爾泰山地區(qū)距今3.3萬年前的犬科遺骸，曾被依據(jù)形態(tài)學(xué)特征認(rèn)定為最早的馴化犬類，但后續(xù)的古基因組分析顯示，其遺傳譜系仍屬于灰狼分支，并非完成馴化的家犬，再次印證了全基因組技術(shù)在早期家犬鑒定中的不可替代作用。

從15800年前的安納托利亞半島，到14200年前的歐洲大陸，再到12900年前的東亞大地，從冰河時(shí)代的狩獵采集營(yíng)地，到如今的千家萬戶，狗和人類的陪伴從來都不是一時(shí)的緣分。

這份刻在基因里的羈絆，不僅熬過了冰河時(shí)期的嚴(yán)寒，也扛過了人類文明的劇烈更迭，直到今天，依然在每個(gè)有狗的家庭里，溫暖地延續(xù)著。