一文理清
多種構型異構概念
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在我們日常學習和閱讀文獻時,常常會遇到諸如 R/S、cis/trans、E/Z、syn/anti、endo/exo 等一系列構型術語。這些術語容易在概念上產生混淆。今天我們就簡單的梳理一下。
在梳理各類立體構型術語之前,我們先弄明白相對構型與絕對構型這兩個底層概念。
相對構型與絕對構型
01
絕對構型(Absolute Configuration)指手性中心上原子 / 基團的真實、唯一的空間排布,它不隨參考物而改變。它是根據手性碳原子上四個不同的原子或基團在“順序規則”中的先后次序來確定的,常使用 R/S 標記系統來命名,如圖1。
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圖 1
相對構型(Relative Configuration)是相對于參照物的空間關系,不代表絕對真實排布,常用 D/L、cis/trans等標記。例如糖類、氨基酸等天然手性化合物,通常以甘油醛為參照基準,以此判定其 D/L 相對構型,如圖2。
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圖 2
不同類型的構型標記法
02
2.1 R/S構型 (絕對構型)
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R/S 構型標記法(Cahn–Ingold–Prelog,CIP 規則) 是給手性中心(最常見為連 4 個不同基團的碳) 標記絕對構型的一套通用規則,R/S構型標記法是用于標記手性中心(通常是手性碳原子)絕對構型的國際通用標準。它是以 Cahn-Ingold-Prelog(CIP)順序規則為核心判定依據。具體判斷方法如下:
首先,按照所連原子(元素)的原子序數排列,原子序數大的序號小(優先)。對于所連原子的原子序數相同的情況,我們繼續比較所連原子的所連原子的原子序數。
接下來,重新排列分子結構,讓最小的(次序最低的)基團遠離我們。觀察由1到2再到3的旋轉方向,如果是順時針的,那么在手性中心上標注R;如果是逆時針的,則標注S。(書寫字母 R 時,起筆為順時針方向;書寫字母 S 時,起筆為逆時針方向。可借助這一書寫特征,快速判斷 R、S 構型。)
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圖 3
2.2 E/Z構型
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E/Z構型用來標記含雙鍵結構的絕對立體構型。
國際統一規定:按“順序規則”分別比較每個碳原子上連接的兩個原子或基團,若兩個較優基團在π鍵平面同側為Z型異構體,在異側者為E型異構體。Z和E分別取自德語單詞“Zusammen”和“Entgegen”的首位字母,前者意思是“在一起”,后者的意思是“相反,相對”。
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圖 4
2.3 cis/trans構型
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順反(cis/trans)構型屬于相對構型,僅表達相對空間關系,主要用于描述環狀化合物、烯烴等不飽和結構中取代基的空間相對位置關系。
其中cis表示順式:分子中兩個特定基團位于環平面 / 雙鍵同側;trans表示反式:兩個特定基團位于環平面 / 雙鍵異側。
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圖 5
2.4 endo/exo(內/外)構型
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endo/exo(內/外)屬于相對構型,用來標記雙環橋環化合物,是橋環特有的立體構型命名,不用于普通烯烴、開鏈化合物。
判斷方法:若取代基在反應中指向分子平面的外側,或與雙烯體的雙鍵方向相反,則為exo構型。若取代基在反應中指向分子平面的內側,或與雙烯體的雙鍵方向相同,則為endo構型。
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圖 6
2.5 syn/anti
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syn/anti構型標記法屬于相對構型,很容易與cis/trans構型標記法弄混,但二者有本質區別的:正如前文提到的,cis/trans多用來描述分子本身的靜態立體構型(如環上取代基順反);syn/anti主要用于描述反應過程的立體變化與加成方式,是一個動態的過程。比如順式加成 syn-addition、反式加成 anti-addition、消除反應的 syn/anti 消除等。
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公眾號丨有機合成知識積累
參考文獻:
1.《基礎有機化學》邢其毅等
2.《Organic Chemsitry》clayden等.
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