西湖大學張塏課題組（計算與調(diào)控基因組學實驗室）誠招博士后 / 助理研究員 / 科研助理

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西湖大學張塏課題組

課題組和項目簡介

張塏博士于2018年獲加州大學圣地亞哥分校（UCSD）生物信息學博士學位，2019–2023年在UCSD任兵教授課題組從事博士后研究，長期致力于基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡研究，取得了一系列原創(chuàng)性成果，以第一作者在 Cell、Nature Methods、Nature Immunology、Nature Communications、Science Advances 等頂級期刊發(fā)表多篇論文。課題組已在單細胞表觀遺傳學領域積累了深厚的前期成果，自主開發(fā)了SnapATAC2（Nature Methods，2024）、Precellar （https://github.com/regulatory-genomics/precellar）等一系列高效、可擴展的單細胞多組學分析工具，并在全球范圍內(nèi)被廣泛引用和應用；同時構建了海量高質(zhì)量單細胞與表觀遺傳多模態(tài)數(shù)據(jù)資源庫 （Cell，2021），為大模型訓練、調(diào)控網(wǎng)絡解析和疾病機制研究提供了堅實的數(shù)據(jù)和技術基礎。 課題組目前聚焦基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控機制，綜合運用計算生物學、機器學習與多組學整合分析等跨學科手段，系統(tǒng)解析細胞分化、衰老及重大疾病的表觀遺傳調(diào)控網(wǎng)絡。

因科研發(fā)展需要，現(xiàn)面向海內(nèi)外公開招聘 博士后、助理研究員及科研助理若干名，主要參與以下項目：

1. 基因組學大模型構建與優(yōu)化：整合海量單細胞與表觀遺傳等多模態(tài)基因組數(shù)據(jù)，開發(fā)面向生命科學的預訓練基礎大模型（Foundation Models）。通過底層算法創(chuàng)新，提升模型對順式調(diào)控元件的精準識別能力，并實現(xiàn)從 DNA 序列到基因組功能及表型的跨維度預測。

2. 基于 AI Agent 的單細胞多組學智能解析生態(tài)構建：引入前沿的大語言模型（LLM）與多智能體（Multi-Agent）協(xié)同技術，構建開放、動態(tài)的分析計算生態(tài)。開發(fā)具備自主規(guī)劃、工具調(diào)用與交互推理能力的 Agent 網(wǎng)絡，打通從數(shù)據(jù)清洗到機制解析的“端到端”閉環(huán)。

3. 腎臟疾病時空多組學解析與分子病理診斷模型構建（臨床合作）：聯(lián)合北京協(xié)和醫(yī)院腎內(nèi)科陳麗萌教授頂尖臨床團隊，以高質(zhì)量臨床隊列為依托，綜合運用單細胞多組學（scRNA-seq + scATAC-seq）及空間轉(zhuǎn)錄組技術，解析腎臟疾病細胞類型特異性的致病網(wǎng)絡，構建新型分子病理診斷 AI 模型。

課題組網(wǎng)站：https://lab.kaizhang.org

工作地點：杭州市西湖大學云棲校區(qū)

聯(lián)系人：張塏研究員

招聘崗位及要求

博士后/助理研究員（常年招聘）

崗位職責：

1.獨立或合作開展課題研究；

2.協(xié)助培養(yǎng)學生及科研助理；

3.撰寫研究論文、綜述；

4.獨立或合作撰寫基金項目申請以及參與學術交流

應聘條件：

1.已取得或即將取得計算生物學、生物信息學、人工智能、統(tǒng)計學、基因組學或相關專業(yè)博士學位；

2.有單細胞組學或表觀基因組學研究經(jīng)驗者優(yōu)先；

3.以主要作者身份發(fā)表過較高水平論文，具備良好的英文科研論文寫作與學術交流能力；

4.具有強烈的科研內(nèi)驅(qū)力與團隊協(xié)作精神。

科研助理（常年招聘）

崗位職責：

1.數(shù)據(jù)收集與管理：整理生物樣本相關信息、數(shù)據(jù)預處理、建立和維護數(shù)據(jù)庫；

2.使用生物信息相關軟件與工具進行數(shù)據(jù)分析、統(tǒng)計分析和可視化；

3.協(xié)助實驗室成員完成科研項目，或根據(jù)個人興趣可自主承擔課題項目。

應聘條件：

1.本科及以上學歷，生物信息學、計算機科學、統(tǒng)計學或相關專業(yè)背景；

2.具備較強的數(shù)據(jù)處理、編程與可視化能力，能獨立承擔課題數(shù)據(jù)分析和流程開發(fā)任務；

3.工作嚴謹細致，責任心強，能適應快節(jié)奏的科研環(huán)境。

薪資福利及發(fā)展支持

1.與頂尖科研創(chuàng)新團隊共事，提供充足的科研經(jīng)費、高性能計算集群資源及國內(nèi)外學術會議交流支持；

2.提供具有競爭力的薪酬待遇，博士后按國家及依托單位標準執(zhí)行，表現(xiàn)優(yōu)異者可優(yōu)先推薦申報各類人才項目，優(yōu)秀博士后出站可留校聘為助理研究員；助理研究員/科研助理待遇面議

3.提供完善的社會保險、住房公積金、補充醫(yī)療保險、教職工年度體檢等福利，加入工會后可享受工會會員福利，如節(jié)日及生日福利、教職工療休養(yǎng)、參報醫(yī)療互助等；

4.可享受杭州市博士后生活補貼（24或29萬元/兩年），可申請認定杭州市高層次人才，符合條件者可申請應屆生生活補貼（博士10萬元）、應屆生租房補貼（不超過3萬元）、博士后出站留來杭補助（40萬元）

5.可享受杭州市博士后科研資助（10萬元），對獲得中國博士后科學基金資助和浙江省博士后擇優(yōu)項目資助的，杭州市給予1:1配套資助；

6.協(xié)助博士后申請國家自然科學基金青年項目、中國博士后科學基金及省部級人才計劃；

7.課題組注重成員職業(yè)發(fā)展，全力支持優(yōu)秀博士后出站后申請國內(nèi)外高校教職或頂尖生物醫(yī)藥/AI企業(yè)研發(fā)崗位。

申請方式

請將以下材料合并為單個PDF文件，按照以下任一方式發(fā)送至郵箱，應聘材料主題注明：“應聘崗位-姓名-畢業(yè)院校/當前單位”

1. 詳細個人簡歷;

2. 研究計劃或未來職業(yè)規(guī)劃（1頁，博士后/助理研究員申請者需提供）；

3. 2–3位推薦人姓名及聯(lián)系方式（博士后/助理研究員申請者需提供）。

本招聘長期有效，招滿即止。材料初審合格者，課題組將盡快安排線上/線下面試。所有申請信息嚴格保密。

投遞簡歷請選擇：西湖大學張塏課題組

簡歷投遞方式（可選任一）：

1. 掃描二維碼投遞簡歷；

3. 點擊鏈接投遞簡歷：https://data.bioart.com.cn/f/p0EB2y（復制鏈接至瀏覽器投遞簡歷）

課題組代表論文（* 表示共同第一作者）

1. Zhang, K., Zemke N.R., Armand E.J., Ren, B. A fast, scalable and versatile tool for analysis of single-cell omics data. Nature Methods (2024)

2. Zhang, K.*, Hocker, J. D.*, Miller, M., Hou, X., Chiou, J., Poirion, O. B., ... Ren, B. A single-cell atlas of chromatin accessibility in the human genome. Cell (2021)

3. Zhang, K., Wang, M., Zhao, Y., & Wang, W. Taiji: System-level identification of key transcription factors reveals transcriptional waves in mouse embryonic development. Science Advances (2019)

4. Yu, B.*, Zhang, K.*, Milner, J., Toma, C., Chen, R., Scott-Browne, J., ... Goldrath, A. Epigenetic landscapes reveal transcription factors that regulate CD8+ T cell differentiation. Nature Immunology (2017)

5. Zhang, K., Li, N., Ainsworth, R., & Wang, W. Systematic identification of protein combinations mediating chromatin looping. Nature Communications (2016)

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制版人：半夏