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      Nat Biotechnol |?自適應光學邁入“高保真時代”:戴瓊海/吳嘉敏/盧志團隊提出基于潛空間建模的活體顯微成像新方法

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      在生命科學研究中,細胞及其相互作用構成了復雜生命活動的基礎。從免疫細胞的遷移與協同,到神經網絡中信息的編碼與傳遞,這些過程往往發生在完整的生理環境中,并跨越長時間尺度持續演化。相較于體外實驗條件,活體環境中細胞行為更加真實且具有高度動態性。因此,在活體條件下實現高分辨率、長時 程 、穩定可靠的三維成像,對于理解生命過程的本質具有重要意義1-3

      然而,這一目標 卻 長期受到光學像差問題的嚴重制約。在 活體 組織或復雜生物環境中,由于折射率分布不均 一 ,熒光信號在傳播過程中會發生波前畸變,從而導致成像模糊、結構扭曲甚至信息丟失4。像差不僅降低圖像質量,還會對后續定量分析造成系統性誤差,例如細胞軌跡提取、神經信號分析以及群體行為建模等。因此,如何在復雜活體環境中實現高精度像差校正,成為推動顯微成像技術發展的關鍵科學問題。

      為解決這一問題,自適應光學(adaptive optics, AO)方法被廣泛引入生物成像領域。傳統硬件AO通過變形鏡等光學元件直接調制波前,但其系統復雜、成本較高,且調節速度有限5;計算AO方法則嘗試通過圖像數據反推像差并進行數字校正,雖具有更高靈活性,但在實際應用中,這類方法在面對大像差或復雜樣本時往往精度不足6。此外,現有方法普遍缺乏對多角度信息的充分利用,使得波前估計存在信息不完備的問題。

      近年來,光場顯微技術的發展為這一問題提供了新的解決思路。光場顯微能夠同時采集空間和角度信息,為像差估計提供 了潛在的 豐富維度。然而,如何從高維空間-角度數據中有效提取波動光學信息,并將其用于高精度像差恢復,仍然是一個尚未解決的難題1

      針對上述挑戰, 2026年4月23日, 清華大學戴瓊海/吳嘉敏/盧志研究團隊 在Nature Biotechnology上發表了文章High-fidelity intravital imaging of biological dynamics with latent-space-enhanced digital adaptive optics提出了一種潛空間增強的數字自適應光學方法(latent-space-enhanced digital adaptive optics,LEAO)。 LEAO提出了一種融合物理建模與深度學習的新范式 , 通過在潛空間中 像差波前與樣本結構的語義表征異質性 , 實現了二者的精準提取與解耦,使研究人員能夠在更接近真實生理狀態的條件下觀測生命過程。該方法在神經科學 、 免疫學等多個領域展現出 了 廣闊應用前景,有望推動顯微成像進入高保真觀測的新階段。


      在算法實現上,LEAO保留 了光場數據的 連續波動屬性,將其視為編碼了完整波前信息的高維觀測。LEAO首先通過一個 自 編碼器網絡,將原始空間-角度測量映射至高維潛空間。與直接回歸不同,該潛空間被設計為具有明確的物理語義:其中一部分維度主要編碼樣本結構信息,而另一部分則編碼像差波前。為了實現 潛空間解耦和特征對比學習 ,模型引入了基于三元組的 訓練策略7。一個三元組中,有兩個數據擁有相同結構、不同像差,同時有兩個數據擁有相同像差、不同結構。 對于具有相同像差 / 結構的樣本,其 編碼像差/結構的特征向量在潛空間 中被拉近 ,而對于具有不同像差 / 結構的樣本,其編碼像差/結構的特征向量在潛空間 中被拉 開 。這一策略使得 物理信息 表示在潛空間中形成穩定的流形結構,從而降低了樣本結構變化對像差估計的干擾。在潛空間表示獲得后,一個專門設計的估計器網絡從中提取像差相關特征,并輸出連續的波前相位分布。該波前隨后被用于生成符合波動光學傳播模型的點擴散函數。與傳統方法中反復計算PSF不同,LEAO通過一次前向推理即可獲得穩定的波前估計,顯著提高 了 計算效率。


      圖1:LEAO原理

      LEAO表現出顯著優于現有方法的性能。在大像差條件下(1至5波長范圍),LEAO的像差估計精度相比現有方法顯著提升,并在復雜條件下保持穩定表現。同時,在極低信噪比條件下(低至3.4 dB),LEAO仍能維持高精度估計,而傳統方法已顯著退化。這表明LEAO在 光子受限條件下 具有更強的魯棒性。此外,LEAO對角度采樣數、空間采樣率以及不同成像系統均表現出良好的適應性,在多種光場顯微 參數 配置下 均能夠 穩定工作。

      LEAO進一步展現出其在復雜活體環境中的應用潛力。 通過對 小鼠淋巴結成像,研究人員實現了 數 毫米視場 范圍 內約5000個T細胞的同時觀測與 長達數小時的 動態追蹤。與未校正或傳統 AO 方法相比,LEAO顯著提升了圖像對比度與空間分辨率,使原本難以區分的相鄰細胞得以清晰分離,并支持大規模細胞軌跡的 精準 統計分析 , 為免疫反應過程的系統性研究提供了重要工具。


      圖2:LEAO實現約5 000 個T細胞的高分辨動態追蹤

      小鼠大腦皮層的多區域 同時 成像 會帶來空間非一致的復雜像差,傳統方法難以校正 。通過 “分而治之”的思想,LEAO精準識別不同區域的 空間變化像差, 幫助 研究人員成功恢復了神經元的真實形態與分布,使可識別神經元數量顯著增加,并獲得 了 更加可靠的 功能信號 。這為 介觀 神經網絡功能研究提供了新的技術支撐。


      圖 3 :LEAO矯正空間非一致像差提高神經元鈣信號對比度

      在更加具有挑戰性的 透明 顱骨 腦 成像實驗中,LEAO實現了對 接受創傷性腦損傷造模的小鼠腦 中性粒細胞行為的長時 程監測 。 為了更好地研究腦損傷后的免疫微環境,曲面 顱骨結構 被保持 完整 ,但這給成像過程帶來了更大的光學像差。利用LEAO, 研究人員 首次 記錄 到 了 數千個 中性粒細胞的激活、血管外滲以及遷移 的全 過程。這些動態過程此前由于像差嚴重而難以直接觀測。LEAO不僅恢復了圖像結構,還使得細胞密度與動力學參數得以準確量化。


      圖 4 :TBI鼠與對照鼠的中性粒細胞活動對比

      清華大學自動化系博士 曾昀敏 為本文第一作者,清華大學自動化系 戴瓊海 院士、 吳嘉敏 副教授,心理與認知科學系 盧志 助理教授為本文的共同通訊作者, 張琦、肖一翃、吳世東、金成勛、張云皓、王鳴瑞、張元龍和李欣陽 參與并做出重要貢獻。

      https://www.nature.com/articles/s41587-026-03107-2

      制版人: 十一

      參考文獻

      1. Wu, J. et al. Iterative tomography with digital adaptive optics permits hour-long intravital observation of 3D subcellular dynamics at millisecond scale.Cell184 , 3318-3332.e17 (2021).

      2. Lu, Z. et al. Long-term intravital subcellular imaging with confocal scanning light-field microscopy.Nat Biotechnol43 , 569–580 (2025).

      3. Zhang, Y. et al. Long-term mesoscale imaging of 3D intercellular dynamics across a mammalian organ.Cell187 , 6104-6122.e25 (2024).

      4. Ji, N. Adaptive optical fluorescence microscopy.Nat Methods14 , 374–380 (2017).

      5. Hampson, K. M. et al. Adaptive optics for high-resolution imaging.Nat Rev Methods Primers1 , 1–26 (2021).

      6. Kang, I., Zhang, Q., Yu, S. X. & Ji, N. Coordinate-based neural representations for computational adaptive optics in widefield microscopy.Nat Mach Intell6 , 714–725 (2024).

      7. Schroff, F., Kalenichenko, D. & Philbin, J. FaceNet: A unified embedding for face recognition and clustering. in 2015IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition(CVPR) 815–823 (2015). doi:10.1109/CVPR.2015.7298682.

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