撰文丨王聰
編輯丨王多魚(yú)
排版丨水成文
2020 年 11 月底,谷歌旗下公司DeepMind推出了AlphaFold2,這是一款用于預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的 AI 模型,一舉解決了長(zhǎng)達(dá) 50 年的蛋白質(zhì)折疊難題,其能夠僅根據(jù)蛋白質(zhì)的氨基酸序列就精準(zhǔn)預(yù)測(cè)出蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。AlphaFold2 一經(jīng)推出,迅速火遍世界,不僅得到了全世界科學(xué)家的廣泛使用,更為它的開(kāi)發(fā)者John Jumper和Demis Hassabis贏得了獲得了 2024 年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。
2021 年,DeepMind 拆分創(chuàng)立了一家名為 Isomorphic Labs 的 AI 藥物研發(fā)公司,由Demis Hassabis出任 CEO,該公司有著一個(gè)宏大的目標(biāo)——利用 AI 變革藥物發(fā)現(xiàn),解決所有疾病。
一年前,Isomorphic Labs在首次外部融資中募集了 6 億美元,2026 年 5 月 12 日,該公司宣布完成21 億美元的 B 輪融資,創(chuàng)下了 AI 制藥領(lǐng)域單輪融資規(guī)模新紀(jì)錄。此輪融資由 Thrive Capital 領(lǐng)投,現(xiàn)有投資者 Alphabet 和 GV 以及新投資者 MGX、淡馬錫、CapitalG 和英國(guó)主權(quán)人工智能基金跟投。
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Isomorphic Labs在聲明中表示, 這筆資金將用于 Isomorphic Labs 的 AI 藥物設(shè)計(jì)引擎IsoDDE的持續(xù)開(kāi)發(fā)和部署,加快并擴(kuò)大其臨床前治療項(xiàng)目的研發(fā)進(jìn)程。此外,這筆資金將通過(guò)在全球各站點(diǎn)整合世界一流的 AI、工程、藥物設(shè)計(jì)和臨床人才,來(lái)支持公司現(xiàn)有的招聘目標(biāo),以幫助實(shí)現(xiàn)公司的長(zhǎng)期愿景——利用 AI 驅(qū)動(dòng)的突破來(lái)應(yīng)對(duì)最復(fù)雜的生物和醫(yī)療挑戰(zhàn),并解決全球疾病負(fù)擔(dān)問(wèn)題。
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Demis Hassabis
Isomorphic Labs創(chuàng)始人兼 CEO,諾獎(jiǎng)得主Demis Hassabis表示,此輪融資是眾多頂級(jí)國(guó)際投資者對(duì)我們以 AI 為先的藥物設(shè)計(jì)與開(kāi)發(fā)方法投下的巨大信任票。既然我們已經(jīng)證明了我們的方法從根本上是可靠的,那么接下來(lái)的重點(diǎn)就是將這些技術(shù)擴(kuò)展到其全部潛力。這筆資金的注入將使我們能夠大規(guī)模構(gòu)建藥物設(shè)計(jì)引擎,推動(dòng)我們朝著解決所有疾病的目標(biāo)前進(jìn)。
2021 年 7 月,DeepMind在Nature期刊發(fā)表論文,公布了AlphaFold2的開(kāi)源代碼,并發(fā)表了完整方法論,詳盡細(xì)致說(shuō)明了 AlphaFold2 是如何做到精確預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的。
2024 年 5 月,DeepMind在Nature期刊發(fā)表論文,推出了 AlphaFold2 的全面升級(jí)版——AlphaFold3。與 AlphaFold2 相比,AlphaFold3最大的進(jìn)步在于——不僅能預(yù)測(cè)單個(gè)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),還能預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)與幾乎任何生命分子(包括配體、蛋白質(zhì)、DNA 和 RNA)的相互作用。
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2024 年 11 月,DeepMind 宣布AlphaFold3開(kāi)源,允許研究人員下載其底層代碼并將其應(yīng)用于非商業(yè)領(lǐng)域。
2026 年 2 月,Isomorphic Labs推出了 AI藥物設(shè)計(jì)引擎——IsoDDE(Isomorphic Labs Drug Design Engine),并進(jìn)一步展示了其強(qiáng)大且廣泛的功能中的一部分。
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Isomorphic Labs 表示,IsoDDE 開(kāi)啟了理解生物分子世界的新范式,實(shí)現(xiàn)了前所未有的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性(在預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性方面超越了 AlphaFold3,并引入了新功能),彌合了結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與現(xiàn)實(shí)世界藥物發(fā)現(xiàn)之間的差鴻溝,從而能夠在計(jì)算機(jī)上以極高的精度和理解力理性設(shè)計(jì)新藥。外界也將IsoDDE 理解為AlphaFold4,只是不再開(kāi)源。
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蛋白質(zhì)-配體結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性
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抗體-抗原結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性
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結(jié)合親和力預(yù)測(cè)性能
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僅提供 cereblon 蛋白的序列,IsoDDE 就能預(yù)測(cè)出了已知和新發(fā)現(xiàn)的隱匿位點(diǎn),而無(wú)需指定配體
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