近日,深圳醫學科學院顏寧團隊聯合清華大學團隊,在《科學》發表糖質結構研究重磅成果。據深圳醫學科學院24日消息, 這項成果為復雜糖質高級結構的發現、鑒定與工程化利用提供了新的方法學框架,標志著糖質結構生物學正進入原子分辨率解析的新階段。
4月24日,顏寧在個人微博轉發了深圳醫學科學院發文,并表示:“忍不住得瑟的一個工作——我們2024年發表第一個跟糖質相關的結構,過去兩年通過CryoSeek發現大量糖質結構(都在# 收錄),但一直不知道來自何方。這次通過對金藻微絨毛高達1.8埃分辨率的結構分析,不僅刷新了我們對糖質結構的理解,而且確立了一個很好的研究體系。祝賀我優秀的團隊!”
4月26日,顏寧針對冷凍電鏡技術的發展和一些“黑粉”言論作出回應。顏寧在個人微博中寫道:“AlphaFold突破,無知者:‘顏寧的專業被取代了,混不下去回國了’【不是,這么說話的人有沒有意識到自己心里是多崇洋媚外啊,合著潛意識就覺得出國才是升,只有混不下去才能回國,而不是因為更好的環境?都21世紀第三個十年了,某些人骨子里的那些自卑就別無知無畏地丟人現眼了】;專業人員:AI賦能,終于又能擺脫一部分重復勞動了,可惜AF還不太行,好多預測不出來或者預測不準。”
顏寧近期接受《人民日報》記者專訪,聚焦其團隊在糖質生物學領域的最新突破。
據人民日報客戶端4月29日消息,顏寧近期接受《人民日報》記者專訪,聚焦其團隊在糖質生物學領域的最新突破。
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顏寧近照。圖源:深圳醫學科學院
報道提到,深圳醫學科學院/深圳灣實驗室/清華大學顏寧團隊與合作者利用“酷尋”(CryoSeek)策略,逐步揭開了糖質這一“生命暗物質”的神秘面紗。
特別是,在《科學》雜志發表的最新成果中,顏寧團隊獲得了最高分辨率達到0.18納米的天然糖質復合物超高分辨率三維結構,實現了在原子分辨率的“可視化”研究,打開了糖質生物學研究的“天眼”。
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冷凍電鏡分析揭示金藻管狀微絨毛表面存在的大量復雜糖質及其近原子分辨率三維結構。圖源:深圳醫學科學院
在采訪中,顏寧指出,糖質雖與核酸、蛋白質、脂質并列為生命四大基本生物大分子,卻長期研究滯后,“根本原因之一是糖質研究中存在一個巨大的瓶頸——科學家看不清它的內部結構。”
顏寧解釋說,“在生命科學領域,結構決定功能。這里的‘結構’,既包括長寬高外形這些幾何形式,也包括所用的材料等物理化學性質。就像家里面,不同的結構、材料決定了這個地方是廚房、那個地方是衛生間一樣,生物大分子的結構不同,所具有的功能和作用也各不相同。”
“因為一直缺乏好的研究系統,所以過去即便用最強大的冷凍電子顯微鏡也很難‘看清’復雜糖質的內部構造。”顏寧說。
為此,顏寧團隊另辟蹊徑,創造性地提出酷尋(CryoSeek)研究策略——“結構先行”的生物發現新范式。“核心是把冷凍電鏡這一傳統的結構解析工具變為發現未知生物大分子的‘放大鏡’”。
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CryoSeek數據平臺首頁。圖源:深圳醫學科學院
今年4月24日,發表在《科學》上的最新研究進展中,顏寧團隊以年輕的博士生黃雋豪為主力、與清華大學閆創業團隊合作,獲得了整體糖質分辨率約0.2納米(一根頭發絲的40萬分之一)、核心局部最高達0.18納米的超高分辨率三維電鏡密度圖。
顏寧告訴記者:“在這項研究中,我們系統揭示了糖質在生物大分子高級組裝中的結構性作用,為復雜糖質及其高級結構的發現、鑒定、計算化學、工程化利用提供了新的方法學框架,標志著糖質結構生物學正進入原子分辨率解析的新階段。”
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在《科學》發表的論文截圖。圖源:深圳醫學科學院
與此同時,由顏寧實驗室博士后陳晟開發的AI自動建模工具EModelG,把糖質結構建模的效率從傳統手動建模的幾星期提升到自動建模的半小時,為天然糖質的大規模結構研究提供了方法學支撐,并降低了復雜的專業門檻,可以令不同學術背景的更多研究者有效參與進來。
值得一提的是,在該論文于國際期刊正式發表之前,顏寧團隊提前幾個月將成果公開發布在由深圳醫學科學院聯合深圳灣實驗室、清華大學、西湖大學建設的 “浪淘沙”預印本平臺(Langtaosha.org.cn),第一時間與國內外同行分享研究的核心發現、技術方法與原始數據,以加快推進相關研究。
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“浪淘沙”預印本平臺網頁。圖源:深圳醫學科學院
一花獨放不是春,百花齊放春滿園。顏寧表示,與核酸、蛋白質相比,糖質生物學的研究還是“萬里長征第一步”,前面是更為廣闊的星辰大海,需要國內外同行攜手努力。
(來源:人民日報)
顏寧:說這話的人多崇洋媚外啊
近日,中國科學院院士、深圳醫學科學院創始院長、深圳灣實驗室主任顏寧針對冷凍電鏡技術的發展和一些“黑粉”言論作出回應。
4月26日,顏寧院士通過個人微博發文:“娛樂博主潛水多了,經常看到一個說法‘粉黑都滿意’——這個好像也特適用于我們學科耶。冷凍電鏡技術橫空出世(這真的是game changer),三位在該領域深耕半世紀的前輩得諾獎,無知者:‘看,他們只會利用電鏡發論文灌水’;結構生物學研究人員則是喜大普奔,終于不用把寶貴的時間用在令人絕望的結晶這一步了,我們被賦能了,加速了理解生命、藥物研發的進程。”
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顏寧在個人微博中寫道:“AlphaFold突破,無知者:‘顏寧的專業被取代了,混不下去回國了’【不是,這么說話的人有沒有意識到自己心里是多崇洋媚外啊,合著潛意識就覺得出國才是升,只有混不下去才能回國,而不是因為更好的環境?都21世紀第三個十年了,某些人骨子里的那些自卑就別無知無畏地丟人現眼了】;專業人員:AI賦能,終于又能擺脫一部分重復勞動了,可惜AF還不太行,好多預測不出來或者預測不準。”
顏寧介紹,“我們4月20日周一的Cell Chemical Biology是把之前早就放在預印本的荷塘月色鑒定出來的若干糖纖維正式發表,這不僅僅是報道結構,更是把自然界生物世界不為人知的一隅呈現出來,換言之,是發現了此前生物世界完全不知道的物質,直觀看到了這些,特別是完全沒有蛋白的純糖纖維,毫無基因組序列可以參考,既激動人心,研究起來又困難重重。下一步就是三連問:它們是什么?它們做什么?它們從哪里來?(生物本質、生物功能、生物合成通路),這就是我們實驗室正在吭哧吭哧做的。所以我們才說cryoseek 酷尋是一個結構優先的發現策略。而緊接著上線的Science論文(投稿前全文可在浪淘沙預印本平臺免費開放獲取)則是確立了一個研究體系,可以就其中我們命名為TLP-4的一類糖纖維展開系統研究了。高達0.2納米分辨率的結構令我們精確地看到每一種糖,每一個結合的水分子,每一個金屬離子——這在此前難以想象。而這個金藻株系連基因組序列都還沒有,所以我們要先測序,才能開展后續很多實驗。即便如此,多糖的序列并不能從基因組推測出來,AlphaFold連序列都沒有,怎么預測啊?就算有序列,之前沒結構,它也沒法被訓練啊。”
顏寧最后寫道:我們現在要做的就是盡可能從一切重復勞動中進一步被解放,這是另外一個故事,現在要開會去了,晚上有空接著寫。
稍早前,4月23日,顏寧團隊聯合清華大學團隊在《科學》發表重磅成果。這項成果為復雜糖質高級結構的發現、鑒定與工程化利用提供了新的方法學框架,標志著糖質結構生物學正進入原子分辨率解析的新階段。該研究核心成果早在2026年1月28日就已通過浪淘沙預印本平臺面向全球首發,第一時間公開了研究的核心發現、技術方法與原始數據,比正式期刊發表時間提前了近3個月。
基礎生物學家顏寧主要從事膜蛋白結構生物學研究,1977年11月生于山東省濟南市,2000年于清華大學獲學士學位,2004年于美國普林斯頓大學獲博士學位,分別于2019年及2023年當選為美國國家科學院外籍院士及中國科學院院士。
顏寧在科學研究方面有開拓性的貢獻,她的實驗室率先成功闡明幾種關鍵膜蛋白原子結構,為藥物研發提供了重要啟示,其研究成果發表于《自然》《科學》《細胞》等世界頂尖學術期刊,更曾兩度被《科學》期刊評選為十大科學突破之一,其研究的影響延伸到醫學的實際應用,尤其在理解疾病機理和開發新的治療方法方面。
顏寧近年返回中國內地建立和領導深圳醫學科學院,致力推動祖國的生命科學研究和教育。她的為人哲學是“作為女科學家可能充滿挑戰性,但并不至于阻止任何人前行;因此,勇往直前,做好自己本分”,激勵年輕科研人員,成為女性典范。她于2024年獲歐萊雅-聯合國教科文組織世界杰出女科學家獎,進一步突顯她作為全球科學研究領導者的地位。
(來源:澎湃新聞)
顏寧團隊發布重磅成果!顏寧:忍不住嘚瑟
據深圳特區報25日報道,近日,深圳醫學科學院顏寧團隊聯合清華大學團隊,在《科學》發表糖質結構研究重磅成果。據深圳醫學科學院24日消息, 這項成果為復雜糖質高級結構的發現、鑒定與工程化利用提供了新的方法學框架,標志著糖質結構生物學正進入原子分辨率解析的新階段。
4月24日,顏寧在個人微博轉發了深圳醫學科學院發文,并表示:“忍不住得瑟的一個工作——我們2024年發表第一個跟糖質相關的結構,過去兩年通過CryoSeek發現大量糖質結構(都在# 收錄),但一直不知道來自何方。這次通過對金藻微絨毛高達1.8埃分辨率的結構分析,不僅刷新了我們對糖質結構的理解,而且確立了一個很好的研究體系。祝賀我優秀的團隊!”
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據深圳特區報報道,顏寧團隊搭建高分辨率冷凍電鏡、糖蛋白質組學與AI建模融合研究體系,獲得約2?整體分辨率、核心局部1.8?的超高分辨率三維電鏡密度圖,將天然糖質復合物研究推進至近原子分辨率層面。
糖質是生命四大基本生物大分子之一,在細胞識別、信號轉導、免疫調控和結構支持等多種生理過程中發揮關鍵作用。此次研究結果的分辨率水平使對天然糖質的直接可視化成為可能,不僅支持多種單糖類型的精確識別,也為乙酰化、甲基化和硫酸化等多種共價修飾的判定提供了明確的結構依據。
在此基礎上,研究者還通過整合結構生物學研究與靶向質譜技術,發現了一類基于“AND”基序的新型非經典N-糖基化類型,并借助結構聚類搜索揭示了該基序在多種高致病性物種中的進化保守性。
與此同時,由顏寧實驗室開發的AI自動建模工具EModelG顯著提升了糖質結構自動建模的效率,推動糖質結構解析從依賴間接片段信息推斷向高精度直接建模轉變,也為復雜天然糖質的大規模結構研究提供了方法學支撐。
據深圳醫學科學院24日消息,顏寧團隊的該項研究核心成果早在2026年1月28日就已通過浪淘沙預印本平臺面向全球首發,第一時間公開了研究的核心發現、技術方法與原始數據,比正式期刊發表時間提前了近3個月。相關內容很快被Google Scholar、ResearchGate等主流學術平臺收錄,為相關研究提供了重要參考、避免了重復研究,充分展現了預印本模式在加速學術傳播、推動開放科學發展中的核心價值。
另據報道,南方科技大學薛其坤-陳卓昱團隊聯合多單位,在無限層鎳氧化物超導體研究領域取得重要突破。近日,成果發表在國際頂尖學術期刊《自然》。值得一提的是,這也是薛其坤-陳卓昱團隊繼4月8日在《自然》發表關于鎳基氧化物薄膜超晶格的超導電性與電子結構的文章之后,半個月內發表的第2篇國際頂刊論文。
兩項成果分別在量子材料、生命科學領域實現原創性突破,是深圳基礎研究持續深耕結下的又一碩果,為相關領域科學研究與產業應用提供了策源動力。
(內容來源:深圳特區報、深圳醫學科學院、@顏寧、南方都市報)
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